Snake ต่อสู้กับ Liquid ที่ขับ Hind ยิงเขา และเอาชนะยิง Hind ตกด้วย Stinger ปืนยิงจรวด แล้ว.. Snake ถูกหลอกให้ยับยั้งการปลดล๊อค มารู้ว่า Liquid และพวกนั้นไม่ได้มีรหัสปลด.. Snake ต่อสู้ฝ่ารถถังของ Vulcan Raven เพื่อไปช่วยดอกเตอร์ Hal Emmerich ที่ห้องแลปใต้ดินอา..